تأسست جامعة هليوبوليس بالقرار الجمهوري 298/2009 في عام 2009.
في عام 2012 ، التحق أول 128 طالبًا بكليات الأعمال والاقتصاد والهندسة والصيدلة.

تم تطوير فكرة إنشاء جامعة مستدامة من قبل إبراهيم أبو العيش ، قائد مبادرة سيكم ، التي تأسست عام 1977. تعتبر الجامعة في رؤيته جزءًا مهمًا في مبادرة سيكم. مثل أجزاء أخرى من سيكم ، تتبع الجامعة مبادئ الاستدامة. تنقسم هذه المبادئ إلى أبعاد مختلفة ، مثل الحياة المجتمعية والثقافية والتجارية ، والتي يجب أن تسير جنبًا إلى جنب مع البيئة. عالجت مبادرة سيكم هذه الأبعاد الأربعة الرئيسية في إطار عمل محدد يسمى الزهرة المستدامة.

بناءً على هذا الإطار ، لا يتعلم الطلاب مناهجهم المحددة فحسب ، بل يأخذون أيضًا دروسًا في الفنون والثقافة والعلوم الاجتماعية والدراسات البيئية واللغات الأجنبية. يتم التعامل مع هذه المهارات في دراسة إلزامية تسمى البرنامج الأساسي. لأغراض التدريس ولتعزيز الاستدامة ، تدير جامعة هليوبوليس نظامًا لمياه الصرف الصحي والعديد من التركيبات الكهروضوئية ، ويمكن للطلاب والموظفين استخدام الكافيتريا والمطعم ، فضلاً عن المرافق الرياضية والترفيهية. علاوة على ذلك ، تم دمج حديقة نباتية في حرم الجامعة.